Den danska kronan ägde gården förr och gav den som förlägning till bland annat Tycho Brahe och familjen Tott. Då Skåne blev svenskt år 1658 övergick egendomen till svenska kungahuset.

År 1747 ärvde familjen Hamilton i Barsebäck Habo gård och alla utgårdarna som hörde till med 2000 tunnland. Habo gård blev då ett säteri.

Knappt hundra år senare, år 1851, sålde Hamilton Habo gård till familjen Calldéns.  Den svenske kungen Karl XV bodde på Habo gård i 11 dagar under en höstmanöver i Skåne.

Under de sista hundra åren har gården bytt ägare många gånger. Den nuvarande ägaren Lunds kommun, övertog gården 1950 av den dåvarande ägaren Bager-Sjögren. Köpet gick på 811 000 kronor.

Det var den långa kuststräckan på 1, 5 kilometer som lockade Lunds kommun och det är fortfarande många boende i Lunds som minns badbussarna som under sommarsäsongen körde till Habo gård i Lomma. Badresorna syftade till att ge barnen i staden en möjlighet att uppleva havet och stranden, särskilt för de som inte hade möjlighet att resa iväg på annat håll under sommaren. Barnen fick hämta ett badkort i mjölkaffären som de skulle visa upp på bussen. Efter badet fick barnen mjölk och släta bullar.

Tre år efter att Lunds kommun köpt gården gjordes en skrivelse till regeringen med en begäran om att Habo gård skulle inkorporeras med Lunds kommun. Begäran avslogs.

Statens Forskningsanstalt för Lantmannabyggnader arrenderade gården till 1964 då agronomen Gotthard Dieden, övertog arrendet.

Numer finns det ingen kuststräcka som tillhör Habo gård och det är verksamheten på gården och de natursköna utemiljöerna omkring som är värdefull för besökarna.